Le 10 janvier 2019, François Bayrou devra se présenter devant la 17e chambre correctionnelle de Paris à l'occasion d'un procès pour diffamation. La plainte a été déposée par l'association El Sistema France. Née en 2010 en Loire-Atlantique, cette association à but non-lucratif propose l'apprentissage de la musique classique et s'inspire du programme d'éducation musicale El Sistema, développé au Venezuela en 1975. Son objectif : favoriser l'inclusion sociale des enfants défavorisés. Selon la plainte consultée par l'AFP, l'affaire remonte au 28 septembre 2015. Ce jour-là, lors du Conseil communautaire de Pau-Pyrénées, qui rassemble les élus des 14 communes de l'agglomération paloise, le maire de Pau a critiqué les motivations de l'association qui propose alors de lancer un projet de ce type dans sa ville. La vidéo de cette séance a été diffusée sur Web-TV Pau-Pyrénées et mise en ligne sur Dailymotion. Selon la plainte, François Bayrou a accusé El Sistema France de "s'enrichir indûment en instrumentalisant des expériences humanistes et musicales à son profit" et "en tentant d'extorquer des contributions financières aux communes qu'elle démarche". Le 30 novembre 2016, il a été mis en examen, puis renvoyé devant le tribunal correctionnel le 3 avril 2017. Vendredi 19 mai, en déplacement à Pau, le nouveau ministre de la Justice a maintenu ses accusations. "C'est une association qui a essayé de se faire verser de l'argent par la ville alors qu'elle n'a rien fait pour nous. J'ai refusé et j'ai dit que je n'acceptais pas ces attitudes mercantiles, ce qui n'est pas une injure. Je l'ai dit en tant que maire et je le maintiens", a-t-il déclaré aux journalistes, ajoutant que la mairie avait d'abord cru à la compétence des membres de l'association, avant de réaliser qu'"ils ne savaient rien faire". Ils n'avaient "jamais créé un orchestre", a-t-il fustigé.
