Christophe Jaffrelot est diplômé de l'Institut d'études politiques de Paris, de l'université Paris I-Sorbonne et de l'Institut national des langues et civilisations orientales.

Il est titulaire d’un doctorat en sciences politiques, et est habilité à diriger des recherches à l'Institut d'études politiques de Paris où il enseigne la politique de l’Asie du sud.

Directeur du CERI (Centre d'études et de recherches internationales), Christophe Jaffrelot est l'un des meilleurs spécialistes de l'Asie du Sud en France.